Nature:全新致癌机制,相分离驱动异常染色质成环,促进乳腺癌发展
2021-11-16 03:24 来源:忻州妇科医院
癌症的演进与特异开放性氨基酸内在无序区域(IDR)的氨基酸反常密切涉及。各种氨基酸(包括mRNA因子、核糖调节剂和RNA混合细胞内)当中的IDR通过液-液二者之间(LLPS)成型凝聚质,因素从细胞质成型和诱发耐受到氨基酸mRNA的无数生质过程。
都是的液-液二者之间(LLPS)是指揉合两个不涉及氨基酸凋亡的过程。该过程发生在细胞核内,并能够成型具有各种质理特开放性的域,这些域可以倡导癌症,例如急开放性脑癌的发生演进。在急开放性脑癌当中,核孔细胞内(NUP98或NUP214)的长时间染色体易位造成了一种反常揉合体,它总是保留核孔细胞内 IDR——天冬氨酸和甘氨酸残基(FG)的组合成分散重复多肽。然而,IDR如何造成了氨基酸错误基因表达和发生尚不相符。
2021年6月23日,北边卡罗莱纳的大学教堂山分校 Gang Greg Wang 的团队等 Nature 发表了题为:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的分析专著。
该分析毫无疑问二者之间是癌症成型的马达因素,癌症通过二者之间给予凋亡以构建亚硝酸盐mRNA因子凝聚质,这同时大幅提高了它们的氨基酸组特异开放性开放性并在产物过程当中诱发反常三维核糖结构的成型。该分析是最早将二者之间与癌症成型联系起来的分析之一。因为在其他恶开放性当中观察到了类似的氨基酸揉合,撰文当中洞察的组态也可以解释其他各种类型的癌症。
NUP98–HOXA9包含两个氨基酸基序和一个混合多肽。为了分析NUP98-IDR在脑癌发生当中的起到,分析的团队主要使用敲打除了混合多肽的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。
他们断定,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于破坏相-二者之间凝聚体的化学质质)处理敏感。纯化的NUP98-IDR(N-IDR)细胞内在体外成型液体凝聚质。
为了全面开放性评估FG重复多肽对凝聚质成型的含量依赖开放性和多价开放性的重要开放性,分析的团队制备了内含不同数量FG重复多肽的私营化N-IDR氨基酸。他们断定N-IDR包含38个或36个FG以含量依赖开放性的方式将重复成型的液滴,那些包含27个或11个FG的却不能进行二者之间。确实NUP98–HOXA9当中的IDR以价依赖和含量依赖的方式将构建LLPS。
NUP98–HOXA9通过同源结构域与DNA混合,造成了脑癌发生过程当中的氨基酸疾患。接下来,分析的团队通过核糖免疫沉淀和高通量测序来评估IDR内源开放性的二者之间对NUP98–HOXA9核糖特异开放性开放性的因素。
%-, N-IDRWT/A9具有显着大幅提高的氨基酸组占有率,而与无监督聚类定义的峰值亚类或多或少。此外,宽而密集的激大幅提高子样峰是N-IDRWT/A9所独有的,并且在发育期和脑癌涉及氨基酸富含。
为了全面开放性评估IDR诱发的LLPS在一个大核糖特异开放性当中的起到,他们来进行了遗传学和药理学的分析方法,毫无疑问IDR内源开放性的LLPS在大幅提高嵌合mRNA因子特异开放性开放性方面的因果起到,特别是在激大幅提高子样峰处见到的那些。确实IDR大幅提高揉合体的氨基酸组混合并且大幅提高靶氨基酸激活。
为了检测NUP98–HOXA9通过LLPS成型核糖反转的能力,分析的团队降解了表达N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞的Hi-C图谱,揭示了DNA反转和复制错综复杂的高度涉及开放性。
为了确定N-IDRWT/A9对Hi-C接触基频的因素,他们聚集了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9表达细胞当中500个最强烈的N-IDRWT/A9抢占碱基错综复杂的相互起到除此以外。%-,N-IDRWT/A9反转以基本上与CTCF或多或少的方式将成型,与二者之间马达组态一致。另外,N-IDRWT/A9特异开放性反转重新直达大幅提高子和靶氨基酸错综复杂的直达,支持了揉合mRNA因子的IDR通过二者之间在激大幅提高子样靶点和癌氨基酸错综复杂诱发DNA反转的观点。
综上所述,该分析断定NUP98–HOXA9当中内含的LLPS活开放性IDR对脑癌的发生和亚硝酸盐氨基酸表达应用程序的激活至关重要。这些现像由IDR的能力内源开放性:1)大幅提高mRNA因子与氨基酸组靶点的混合;2)倡导大幅提高子和癌氨基酸启动子错综复杂的中距离反转。
该分析共享了一个亚硝酸盐凋亡的分析方法开放性证据,该凋亡在产物过程当中倡导LLPS马达的mRNA因子混合和3D核糖私营化。由于含IDR的LLPS活开放性小分子与广为的癌症有关,该分析洞察的组态也可以解释其他各种类型的癌症。
零碎出处:
Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.
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